تتلخص رسالة البرنامج في تأهيل الكوادر المواطنة من مجندي الخدمة الوطنية البديلة لإدارة وتشغيل المنشآت الغذائية الحيوية وشركات الشؤون اللوجستية على مستوى الدولة في حالات الطوارئ والأزمات يتم من خلاله تدريب المجندين وفق مدة زمنية محددة  وإكسابهم الخبرة والكفاءة والجاهزية اللازمة لإدارة وتشغيل هذه المنشآت وقت الطوارئ والأزمات بالتنسيق مع هيئة الخدمة الوطنية والاحتياطية لضمان تحقيق الأمن الغذائي.